Важнейшими активными центрами, расположенными вдоль позвоночника, являются семь так называемых чакр. Они состоят из нервных узлов, кровеносных и лимфатических сосудов. Чакры своеобразные аккумуляторы и одновременно генераторы бионергии ци. Каждой чакре соответствуют определенные вибрации; например цвет (длина волны) или звуки  особой мантры (звуковые колебания). Нижние чакры (с первой по третью) резонируют с низкими частотами Земли, а верхние ( с четвертой по седьмую) откликаются на высокочастотные колебания Космоса.

Таким образом, человеческий организм рассматривается как открытая система, входящая в общую энергетическую систему Земля-Космос. Восточные целители умели воздействовать на чакры с помощью драгоценных камней, которые также обладают определенными частотными характеристиками. На больные органы, точки или соответствующие чакры клали либо «иньские» камни, вытягивающие боль и ослабляющие избыточную энергетику, либо камни «янские», которые способны «подпитывать» энергией, возбуждать и стимулировать. В этом отношении методика древних восточных целителей в корне отличается от практики западных астрологов, подбирающим камни людям в соответствии с данными их гороскопов. Часто люди не подозревают, что их недомогание связано с неверно выбранным украшением.

Ниже приводится список чакр с указанием драгоценных минералов, способных оказывать на них то или иное влияние.

Сахасрара (в области темени) агат, алмаз, ангидрит, горный хрусталь, жемчуг, кахолонг, кальцит, кварц, топаз, флюорит, циркон, чароит.

Аджна (на уровне середины лба) агат, азурит, аметист, кварц, малахит, сапфир, флюорит.

Вишудха (в районе горла) агат, азурит, аквамарин, амазонит, апатит, бирюза, жемчуг, кошачий глаз, халцедон, чароит.

Анахата (в районе сердца) авантюрин, агат, актинолит, александрит, беломорит, берилл, гелитроп, изумруд, диопсид, жадеит, змеевик, кальцит, лунный камень, малахит, нефрит, родонит, родохрозит, рубеллит, рубин, сагилит, серафинит, хризоберилл, хризопраз, чароит.

Манипура (в районе солнечного сплетения) агат, апатит, берилл, жадеит, змеевик, кремень, малахит, нефрит, оникс, тигровый глаз, хризолит, цитрин.

Свадхистхана (священная, ниже пупка) агат, альмандин, гематит, гелиотроп,  рубин, шпинель.

Муладхара (нижняя, в районе крестца) агат, актинолит, гагат, гематит, гранат, обсидиан, раухтопаз.